关于圪塔寺的起源,《西安地名文化》里提到一个传说:相传清初城里有一位倒霉的董姓官员,在仕途不顺、妻子逃失的打击下,自称“看破红尘”,落发为僧。董姓官员划宅内一间房建为寺庙,从此就有了“圪塔寺”。据传当时有人给这位“董和尚”送了副对联曰:“归佛出家却在家中住”“解脱苦海仍在海中游”,横批“空空实实”。可见大家认为“董和尚”心里仍有一个解不开的“疙瘩”。坊间传说虽不一定真实,但也是圪塔寺所承载的文化信息之一。对于“圪塔寺”,民间还有两种其他释义。其一认为,“圪塔”与“圪垯”都是“疙瘩”的美化谐音,“圪塔寺”即“疙瘩寺”,意为“寺庙很小,像一个小疙瘩”。还有一种说法称,北方话中“圪垯”“圪塔”意为小土丘,而圪塔寺曾坐落在一个土丘顶上,故有此名。圪塔寺的真名今不得而知,但毫无疑问它曾是此间很重要的建筑。